管理人内部控制的原则主要包括：(1)全面性原则。内部控制应当覆盖包括各项业务、各个部门和各级人员，并涵盖资金募集、投资研究、投资运作、运营保障和信息披露等主要环节。(2)相互制约原则。组织结构应当权责分明、相互制约。(3)执行有效原则。通过科学的内控手段和方法。建立合理的内控程序，维护内控制度的有效执行。(4)独立性原则。各部门和岗位职责应当保持相对独立，基金财产、管理人固有财产、其他财产的运作应当分离。(5)成本效益原则。以合理的成本控制达到最佳的内部控制效果，内部控制与股权投资基金管理人的管理规模和员工人数等方面相匹配，契合自身实际情况。(6)适时性原则。股权投资基金管理人应当定期评价内部控制的有效性，并随着有关法律法规的调整和经营战略、方针、理念等内外部环境的变化同步适时修改或完善。