企业出资购买房屋及其他财产，将所有权登记为投资者个人、投资者家庭成员或企业其他人员的。分三种情况处理：1、对个人独资企业、合伙企业的个人投资者或其家庭成员取得的上述所得，视为企业对个人投资者的利润分配，按照“经营所得”项目计征个人所得税;
2、对除个人独资企业、合伙企业以外其他企业的个人投资者或其家庭成员取得的上述所得，视为企业对个人投资者的红利分配，按照“利息、股息、红利所得”项目计征个人所得税;
3、对企业其他人员取得的上述所得，按照“综合所得”项目计征个人所得税。
本题李某是股东，甲公司是公司，所以适用第二条，按照“利息、股息、红利所得”项目计征个人所得税。