市场配置的不足之处主要表现在：(1)市场机制的自发作用容易造成经济总量的失衡。单个分散的市场主体只是从微观局部利益出发，对市场信号做出反应，实现供求总量平衡和经济结构调整需要一个长期、反复的过程，往往要付出巨大的代价，更难以避免资源的浪费；(2)市场规律的作用会引起贫富差距的扩大，甚至出现两极分化，难以实现社会公平和共同富裕，容易造成社会不稳定因素的增长;(3) 市场对于解决生态平衡、环境保护等问题显得无能为力，如果昕任市场的自发作用，反而可能对生态环境和外部经济带来害处。 因此，市场发挥作用的优势是在微观经济领域，对微观经济主体的行为能够进行有效的调节。